在疾病机制研究不断向细胞功能与分子动态深入的今天，蛋白组学“看得见表达，却看不见活性”的局限性日益突出。尤其是在肿瘤与神经系统疾病等复杂疾病中，蛋白质功能状态的改变往往比表达量的变化更能揭示真实的生物学本质。

活性位点探针蛋白质谱（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）作为功能蛋白组学的代表技术，凭借其“只捕捉活的蛋白”的能力，已被广泛用于识别疾病相关的活性蛋白酶、功能靶点和潜在生物标志物。本文将聚焦ABPP如何在肿瘤和神经系统疾病研究中发挥独特价值，为靶点发现与机制解析打开新思路。

一、ABPP技术概览

ABPP技术的核心在于利用结构特异性探针共价标记处于“活性状态”的酶类蛋白，结合质谱（LC-MS/MS）进行鉴定与定量。其最大优势在于：

1、捕捉功能蛋白：区别于非活性或前体形式；

2、适用于复杂样本：如肿瘤组织、脑组织、脑脊液；

3、揭示动态变化：对比疾病状态下的活性变化谱。

ABPP尤其适合研究酶类蛋白（如丝氨酸酶、半胱氨酸酶、脱酰化酶等）在疾病状态下的激活、失活与调控。

二、ABPP在肿瘤研究中的应用价值

肿瘤细胞的一个典型特征是代谢与信号传导通路的重编程，许多与恶性转化、浸润转移相关的蛋白酶类，在肿瘤中呈现异常激活状态，而这些变化常常无法通过传统蛋白组检测手段察觉。

1、精准识别肿瘤中的“活性酶类靶点”

研究表明，某些基质金属蛋白酶（MMPs）在肿瘤微环境中虽表达水平不高，但活性异常强烈，参与癌细胞的基底膜穿透与迁移。ABPP可直接标记这类活性酶，绘制肿瘤组织的酶活图谱，识别真正值得开发的治疗靶点。

2、探索药物作用机制与脱靶效应

ABPP可用于分析小分子抑制剂的靶点谱——不仅可以确认目标蛋白是否被抑制，还可筛查潜在的脱靶蛋白酶活性，降低药物副作用风险。例如，在蛋白酶抑制剂开发过程中，ABPP常被用于验证候选化合物的特异性，及其在体内是否影响非目标蛋白活性。

3、开发肿瘤生物标志物

通过比较肿瘤与邻近正常组织的蛋白酶活性谱，ABPP有望筛选出仅在癌组织中激活的标记酶，用于液体活检或早期诊断。

三、ABPP在神经系统疾病研究中的应用

神经系统疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病、ALS等）通常涉及复杂的蛋白质聚集、酶调控失衡与细胞死亡过程。ABPP技术可在早期阶段识别酶活性异常的关键节点，为机制解析与干预策略提供重要参考。

1、揭示神经退行性过程中的酶活变化

ABPP可监测如半胱氨酸蛋白酶（caspase family）在不同疾病进程中的活性变化，明确哪些酶在神经元凋亡启动中扮演关键角色。

2、比较正常与病理脑组织的“功能蛋白组”

相较蛋白组学仅显示表达差异，ABPP能提供神经组织中真实活跃蛋白酶的动态图谱，适合用于：

（1）药物筛选前期评估

（2）脑区特异功能靶点挖掘

（3）神经炎症过程机制研究

3、推动脑脊液（CSF）活性标志物开发

脑脊液样本极具临床转化潜力，但成分复杂、蛋白丰度差异大。ABPP富集技术可显著提升低丰度活性蛋白的检测灵敏度，助力开发早期诊断标志物。

百泰派克生物科技：ABPP在肿瘤与神经系统疾病研究中的一站式解决方案

针对ABPP在疾病研究中的应用需求，百泰派克生物科技已建立覆盖“实验设计→探针标记→富集→质谱→数据分析”的完整技术服务平台：

1、多类型酶类ABP探针筛选与定制

2、支持细胞、组织、脑脊液、动物模型等样本类型

3、搭载Orbitrap Exploris 480高分辨质谱平台

4、提供专业的靶点筛选、通路富集与活性谱可视化服务

ABPP的最大价值，在于它使研究者不仅能看到蛋白质的“表达”，更能理解它们是否“正在发挥功能”。对于机制高度复杂的肿瘤与神经系统疾病来说，只有基于活性状态的信息，才能真正触及疾病的本质过程。百泰派克生物科技擅长在肿瘤组织样本与神经系统样本中进行高灵敏度的ABPP实验，服务项目可广泛应用于基础研究、药物开发与靶点验证。

如果您正计划开展肿瘤或神经疾病的靶点筛选、机制研究或药效验证项目，欢迎联系百泰派克生物科技，我们将为您提供高覆盖率、高特异性、高可视化的ABPP解决方案，助力科研更进一步。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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